کشف اجساد قربانیان کشتار مخالفان قذافی در دهه هشتاد میلادی در سردخانه های طرابلس، بار دیگر سؤالاتی را درباره سرنوشت امام موسی صدر، و همراهانش مطرح کرده است.
اجساد 18 شهروند لیبیایی که از مخالفان قذافی در دهه هشتاد قرن گذشته بودند در سردخانه بیمارستان مرکزی طرابلس کشف شد. گفته می شود که این افراد از مخالفان رژیم قذافی بودند. با وجود اینکه به علت آثار فراوان شکنجه بر روی اجساد، و گذشت زمان شناسایی آنها دشوار بود؛ کارشناسان با استفاده از فناوری DNA توانسته اند تاکنون هویت سه تن از این قربانیان را شناسایی کنند و قرار است این افراد در مراسم باشکوهی در میدان شهدای طرابلس تشییع شوند. نام این سه شهروند لیبیایی، "محمد سعید الطمزینی"، "خلیفه ابراهیم الحماصی" و "جمال محمد المصراتی" است که به اتهام مشارکت حوادث حمله به باب العزیزیه (محل اقامت قذافی با هدف سرنگونی رژیم وی) در سال 1984 اعدام شده یا به دار آویخته شده اند. "ناصر الدعیسی" نویسنده لیبیایی و کارشناس مسائل جهان عرب، درباره اینکه آیا می توان پیکر "امام موسی صدر" و دو همراهش را در سردخانه ها یا گورستان های مخفی در لیبی پیدا کرد، اظهار داشت: موضوع امام موسی صدر با قربانیان لیبیایی تفاوت دارد. زیرا پیکر امام موسی صدر، به طور کامل مخفی شده است. وی افزود: دلیل این امر، آن است که "احمد رمضان" مسئول دفتر قذافی در هنگام بازجویی اعتراف کرده است که امام موسی صدر به شهادت رسیده است. الدعیسی خاطرنشان کرد: قذافی بر این باور بود که نظام وی قوی است و همچنان به حکومت ادامه خواهد داد و می تواند در راستای بهره برداری سیاسی و رسانه ای و کسب هوادار، اقدام به صحنه سازی نماید. از سوی دیگر گمان می کرد هرگاه موضوع کشته شدن مخالفانش کشف شود قادر خواهد بود با استفاده از ابزارهای متعدد عاملان افشای آن را تحت فشار قرار دهد. "بشیر زعبیه" سردبیر روزنامه "المسار" لیبی نیز درباره دلیل نگهداری اجساد قربانیان به مدت بیش از 30 سال در سردخانه ها گفت: بسیاری از اقدامات نظام قذافی عجیب بود و ما نمی توانیم دلیل منطقی برای آنها بیابیم. زیرا نمی توان به آسانی به دلیل از بین بردن اجساد برخی از قربانیان و نگهداری برخی از آنها در سردخانه ها به مدت بیش از دو دهه پی برد. به نظر می رسد باید این امر توسط یک روانشناس و جامعه شناس مورد بررسی قرار گیرد. این روزنامه نگار لیبیایی درباره اینکه آیا احتمال یافته شدن پیکر امام موسی صدر و دو همراهش در سردخانه های مخفیانه وجود دارد گفت: من گمان نمی کنم چنین اتفاقی بیفتد. زیرا اخیرا هیأت های متعددی از لبنان با هدف بررسی این موضوع، اقدام به سفر به لیبی کرده اند و هیچ گونه اشاره ای به این احتمال نشده است. اما برخی نشانه هایی به دست آمده حاکی از دفن آنها است.