امضای یادداشت تفاهم تهران و بوینس آیرس برای تحقیقات مشترک درباره بمب گذاری در مرکز همیاری یهودیانِ آرژانتین، آمیا(AMIA) در سال ۱۹۹۴، سازمان‌های طرفداراسرائیل در آرژانتین را خشمگین ساخته است.
تهران و بوینس آیرس در ژانویه، یادداشت تفاهمی را با هدف تحقیقات مشترک درباره بمب‌گذاری در مرکز همیاری یهودیانِ آرژانتین، آمیا که در آن ۸۵ نفر کشته و ۳۰۰ تن دیگر زخمی شدند، امضا کردند. آرژانتین با دفاع از تصمیم خود برای امضای این یادداشت تفاهم با ایران، از تعهد قوی به قربانیان و خانوده‌های آن‌ها و همچنین اتخاذ موضعی مخالف در برابر منافع خارجی خاص به عنوان مهمترین دلایل در امضای این توافقنامه نام برده است. هکتور تیمرمن، وزیر خارجه آرژانتین پیشتر گفته بود : « اقدامات فعلی درباره پرونده آمیا درپی جلب حمایت‌های بین‌المللی و همچنین لزوم گفتن این موضوع به ایران و تمامی دنیا مبنی بر این اتخاذ شد که ما اجازه نخواهیم داد تا پرونده آمیا به عنوان توجیهی برای منافع ژئوپولتیکی که هیچ ربطی به قانون و یا منافع جمهوری آرژانتین ندارد، مورد استفاده قرار گیرد.» با این حال، سازمان‌های طرفدار اسرائیل در آرژانتین از جمله هیات انجمن‌های اسرائیل - آرژانتین(DAIA) به مقاومت در مقابل این اقدام دو جانبه ادامه داده ومدعی هستد که این قرار داد « غیرقانونی» است. این درحالی است که دیوانعالی آرژانتین، بالاترین نهاد قضایی در این کشور، قرار است حکم نهایی خود را درباره قانونی بودن این توافق که پس از تصویب در کنگره ملی به قانون تبدیل شده است، صادر کند. شیخ محسن علی، رهبر جامعه اسلامی آرژانتین گفت: « حقایق فاش نشده زیرا این پرونده کاملا بی‌اعتبار است و تنها چیزی که انجام شده این است که کشوری را که مخالف اسرائیل است و روابط دیپلماتیکی با امریکا ندارد، متهم کرده‌اند. آن‌ها به دنبال این هستند تا فردی را مقصر قلمداد کنند و سپس مدارکی برای اثبات آن فراهم کنند.» به‌رغم فشارهای لابی‌های محلی صهیونیستی، سازمان‌هایی مانند اینترپل و عفو بین‌الملل از این یادداشت تفاهم به عنوان گامی مهم در جهت روشن شدن پرونده آمیا نام برده‌اند. مقام‌های رسمی و کارشناسان و رهبران مسلمان نیز می‌گویند این قرارداد، اولین گام محکم برای کشف حقایق درباره این حمله است. علاوه بر این، آلخاندرو گیلس کاربو، دادستان کل ملی آرژانتین اخیرا با تامین هزینه‌های سفر دادستان ویژه آمیا به کنگره امریکا مخالفت کرده است. دادستان آلبرتو نیسمان قرار بود کیفرخواستی را به کنگره امریکا ارائه کند که در آن ایران به «نفوذ» به این کشور امریکای لاتین با هدف راه اندازی « شبکه های اطلاعاتی» متهم شده بود. آرژانتین، پیشتر تحت فشارهای شدید سیاسی امریکا و رژیم اسرائیل، ایران را به دخالت در این بمب گذاری متهم کرده بود. جمهوری اسلامی قویا هر گونه دخالت در این بمب گذاری تروریستی را رد کرده است.